En la actualidad los desechos bioinfecciosos que ingresan al Complejo Ambiental de la ciudad de Santo Domingo tienen el único tratamiento de ser colocados en celdas emergentes, enterrado con cal y tierra. El objetivo de esta investigación es identificar alternativas para un tratamiento óptimo de los desechos peligrosos bioinfecciosos que genera la ciudad de Santo Domingo. Se realizó un análisis histórico de generación de los desechos bioinfecciosos dentro de la ciudad entre el periodo 2014 – 2017 para conocer el promedio de generación de las diferentes rutas de recolección, actividades productivas, parroquias rurales y desecho que más se produce. Los equipos investigados fueron el incinerador, autoclave, microondas, calor seco y radiación. El método de tratamiento considerado fue la desinfección química. Para la selección de uno de estos equipos o método se analizó las características técnicas como capacidad de carga, tiempo de tratamiento, energía y combustible requerido y desecho que se genera post tratamiento. En el caso del análisis económico se analizó los costos de cada uno de los equipos y mediante el cálculo del impuesto a pagar por Kg de generación de desecho bioinfeccioso para saber cuál es el equipo económicamente idóneo. Del análisis histórico se obtuvo que desde enero 2014 hasta diciembre 2016 la generación de estos desechos aumentó a una tasa de crecimiento anual de 27,7 toneladas con una generación promedio de 311,3 TON/año y 0,001 TON/per cápita año que está por debajo de ciudades como Quito y Guayaquil que generan 18.687 TON/año y 26.810 TON/año con una generación de 0,01 TON/per cápita respectivamente. Desde enero hasta junio del 2018 las clínicas con el 54% de generación de desechos bioinfecciosos obtuvieron un promedio de 14.249,55 Kg/mes y el desecho que más se produjo corresponde a los insumos que han estado en contacto con fluidos corporales o procedimientos médicos (Q.86.07) con un promedio de 22.525,52 Kg/mes. El análisis técnico identificó que el autoclave es la mejor elección ya que no genera desechos, gases o cenizas en el proceso de desinfección; esteriliza los desechos bioinfecciosos con una mezcla entre presión y vapor de agua que lo hace al equipo idóneo para esterilizar los desechos bioinfecciosos. Económicamente el equipo más viable son las lámparas UV ya que su costo es de $ 6.970,00, el impuesto a cobrar por Kg de desecho bioinfeccioso generado es de $ 0,03 y el autoclave es el segundo equipo ya que su costo de inversión es de $ 10.000,00 con el costo por Kg de desecho bioinfeccioso es de $ 0,03.